La CGTP tiene una estructura territorial que constituye la suma de organizaciones sindicales de determinada jurisdicción regional, subregional o provincial; es decir está relacionada con los trabajadores que mantienen una relación laboral en un determinado territorio.
La Región Amazonas, cuenta 07 provincias. Estas son: Bagua, Bongará, Chachapoyas, Condorcanqui, Luya, Rodríguez de Mendoza y Utcubamba. Su capital es Chachapoyas.
La CGTP Amazonas cuenta con bases 02 provinciales:
